La biologie des interactions biotiques des plantes : maladies et ravageurs des plantes, protection intégrée des cultures, symbiotes, écologie des populations
Etroitement liée à la biologie des plantes cette thématique vise à comprendre le rôle joué par les interactions avec d’autres organismes vivants dans le développement et le fonctionnement de la plante, que ces interactions soient symbiotiques ou bien de bio-agression et défense. Elle mobilise la génomique, la génétique, la chimie, l’épidémiologie, l’écologie, l’écologie des populations, la modélisation, l’ingénierie de la protection des cultures, le bio-contrôle. Elle étudie les interactions des plantes avec les microorganismes (virus, bactéries, champignons) et macroorganismes (nématodes, insectes…). Elle s’attache à comprendre le rôle du phytobiome, ses caractéristiques et sa dynamique, les processus mis en jeu par exemple pour l’alimentation symbiotique des plantes. Elle étudie les mécanismes et stratégies de bio-agression comme les mécanismes et stratégies de défense de la plante, le développement de résistance chez la plante et chez ses bio-agresseurs. Elle étudie les dynamiques de diffusion des maladies et bio-agresseurs. Elle vise enfin à développer des stratégies de protection et défense des cultures minimisant le recours aux intrants chimiques. Elle couvre un grand nombre de phytopathosystèmes tempérés, méditerranéens et tropicaux.